한국교원대학교 생물교육과

한국교원대 학부생(김성환 (지도교수: 박동선)) 연구 논문, KCI 저널 게재

한국교원대학교 생물교육과 김성환 학생(2021학번, 지도교수 박동선)이 학진등재지 중의 하나인 Brain, Digital, & Learning에 연구논문을 게재(2024년 1월 5일)하였다.

‘차등 발현 유전자 데이터 분석을 위한 유전자 온톨로지와 네트워크 전파를 활용한 키워드 기반 유전자 스코어링 방식’이라는 제목으로 발표된 이 논문은 사용자가 입력하는 키워드를 기반으로 주어진 목록에서 유전자 선별을 해내는 새로운 방식을 설명하고 있다.

기존의 실험적으로 얻은 수치의 해석에만 중심을 두던 유전자 선별 과정과 다르게, 제안된 방식은 연구자가 특별히 강조하고자 하는 범주와 제외하고자 하는 범주 키워드를 설정하여 유전자 선별을 진행하게 된다.

해당 논문에서는 제시된 방식이 랫드 중대 뇌동맥 폐색(middle cerebral artery occlusion, MCAO) 모델에서 얻은 전사체 염기서열 분석 데이터에 적용되었을 때, 기존 수치 해석 중심의 방식에 비해 키워드 연관 유전자를 효과적으로 선별할 수 있는 것을 보였다.

제시된 방식의 데이터 처리 절차

김성환 학생은 ‘이 방식을 통해서 차세대 염기서열 분석 방식으로 얻은 방대한 양의 전사체 자료 분석을 기존방식보다 빠르고 효율적으로 진행하는 데에 도움이 될 것으로 기대한다’고 하였다.

특히, 지도교수인 박동선 교수는 김성환 학생의 연구 업적은 기존의 방법보다 시간과 노동력을 절감할 수 있는 효율적인 방법 이라고 하면 김성환 학생의 연구업적을 칭찬하는 한편, 학부생들도 노력하면 KCI 논문을 쓸 수 있다는 것을 보여줄 수 있는 계기가 되었으면 좋겠다고 하였다